La iglesia de la Magdalena es la capilla del convento de clausura del Corpus Christi de las agustinas recoletas, fundado en 1655 por un grupo de hermanas procedentes del convento de las Tomasas, en el Albaicín. En 1840 fue convertida por orden del gobierno liberal en parroquia de Santa María Magdalena, a raíz del traslado de esta feligresía desde el templo situado en la calle Mesones, el cual fue vendido y demolido para alinear dicha calle.

Su portada, concebida como templo con pórtico abierto a los pies mediante triple arcada, se atribuye a un diseño del maestro Alonso Cano. A la izquierda del templo se encuentra el portón de madera que lleva al claustro del convento, formado por un patio porticado con elementos constructivos mudéjares y una escalera en una de sus esquinas.