Fundado por la viuda de don Hernando de Zafra, secretario de los Reyes Católicos, sobre una serie de casas cedidas por la Corona de bienes que pertenecieron a la nobleza nazarí. De ahí que el convento, además de presentar una fusión de elementos decorativos musulmanes y cristianos, aparezca articulado en varios patios como fórmula para integrar dichas viviendas. La iglesia mudéjar, cuya portada sigue el modelo clasicista popularizado por escuela de Diego de Siloé, sufrió un incendio en el año 1678.