El templo fue iglesia del Colegio de San Pablo de la compañía de Jesús. En 1799 se convirtió en la parroquia de los Santos Justo y Pastor, que estuvo situada junto al vecino convento de la Encarnación. La iglesia se alza sobre una planta de cruz latina y cubre su única nave con una bóveda de cañón con casetones.

Sobre el crucero se eleva una cúpula hemiesférica sobre un tambor articulado con columnas.

La portada principal, situada a los pies, es de dos cuerpos, y alberga un programa iconográfico con santos jesuitas, con un relieve en su segundo cuerpo sobre la conversión de San Pablo. Todo el conjunto está coronado por una estatua de San Ignacio.